蓝藻(学名: Cyanophyceae)是一类真核藻类,细胞中含有叶绿素和藻蓝素。通常呈蓝色、蓝绿色或深绿色。分布于除岩石圈和大气圈以外的各个圈层。蓝藻门的学名是拉丁文中的“ cyanophyta”,意为“蓝色的海洋”,因为它的细胞中含有大量的叶绿素,能够进行光合作用,可以说是真正的“海洋植物”。
蓝藻门生活在淡水中或潮湿土壤里,也见于半咸水和海水中。蓝藻是单细胞生物,细胞结构简单,没有细胞核,只有拟核,细胞壁由果胶质组成,细胞质中有叶绿体,能进行光合作用。最早发现于海洋中,故称“蓝藻”。