莲藕的冬季管理主要是保温、防冻。可以覆盖塑料薄膜,也可在藕田里搭棚架或用稻草包裹起来。一般采取地上部分枯萎,地下部分继续生长的办法过冬。翌年春天气温回升后,把藕田灌满水,待荷叶枯黄时将其割除,再放水让它重新发芽生长。在严寒的冬季,还应适当施肥,以促进植株旺盛生长。
冬种莲藕的种植方式很多,有的地区会直接挖坑埋藏;有的则会利用池塘和大水面进行深沟高畦的方式储存;还有些农户会使用泡沫箱等容器储存;另外,还有不少人会选择利用河流、湖泊、水库、沼泽地等自然条件,通过挖鱼塘储存。